В переводе с армянского «гандз» – означает «сокровище», а «сар» – «гора». Но, говорят, название горы сокровищ Гандзасар получил не за серебряные месторождения. По преданию, именно здесь похоронена голова святого Иоанна Крестителя. Здесь также находится могила самого Хасан-Джалал Долы, князя, по приказу которого на месте старой церкви был воздвигнут величественный монастырь, который считается настоящей хрестоматией армянской канонической архитектуры. Дола был зверски убит иноверцами, под пытками пытавшимися заставить его принять ислам. В итоге тело князя разрубили на мелкие части и именно так передали сыну Атабеку. А похоронили Хасана Джалала Блогочестивого в Гандзасаре, причем место для могилы еще при жизни он выбрал сам: это родовая усыпальница Хасан-Джалалянов, надгробие находится у самого входа. Так, каждый кто входит в помещение, непременно должен пройти по плите – «во искупление земных грехов» князя.
Чудес, связанных с горой сокровищ, много. Говорят еще, что во время военных действий в 1990-е в стенах храма укрылись армянские бойцы. И, несмотря на бомбежку, снаряды как будто летели мимо Гандзасара. А тот единственный, что попал в окружающую храм стену, не взорвался. Место это до сих пор показывают туристам.